美国人看见内华达号堵死了狭窄的水道，顿时急了。很快有两艘拖船上来准备把内华达号战舰拖走，但是早有准备的日军袖珍潜艇侯个正着，两枚鱼雷击中拖船，拖船被击沉在水道内，珍珠港出口水道完全堵死，港内的舰船完全成了瓮中之鳖。

南云中将听完渊田的报告，立即命令马上补充弹药，组成第三批次空袭机队。与此同时他命令登陆舰队，火速向瓦胡岛靠拢，同时命令重巡洋舰、战列舰封锁珍珠港，命令游弋在南部的潜艇部队搜索逃跑的美军舰只，命令驱除舰全力保护登陆舰队实施登陆作战。

此时，福特岛惠勒机场已经被日军突击部队占领，港口方向美军临时组成反击部队进行了一次进攻，可是他们那里是日军的对手，面对日军准确的射杀，美国人吓得魂飞魄散很快失去战意。由于是临时组织的水兵发动进攻，人员十分复杂，再加上水兵根本不会陆战，怕死的美国水兵趴在地上，任凭美军指挥官大声喊叫，他们就是不进攻。

因此，港口方向的美军舰艇军官，鉴于混乱没有统一指挥，只能眼睁睁看着惠勒机场被日军突击队控制。也许有人要问，水面上有众多的舰艇，完全可以用舰炮覆盖整个惠勒机场。但是日军突击队别看人少，他们在机场俘获了大批美军空地勤人员，如果用舰炮覆盖整个机场，己方得的人员死伤，这个责任恐怕没有人敢承担。也许日军正是想到了美国人的想法，才大胆的利用区区两个中队的日军突击队，强行占领惠勒机场，日军的神来之笔，为迅速占领瓦湖岛创造了条件。

渊田率领第三批次起飞前，南云告知，空袭结束后，战斗机群必须回来，轰炸机群可以在福特岛惠勒降落，其目的就是节省时间。因为他已经通过占领惠勒机场的日军突击部队电文，了解了惠勒机场有大批航空炸弹，惠勒机场的弹药库已经被成功占领。

与此同时，他命令火速起飞10架运输机，搭载第8战队300名海军陆战队员，火速增援福特岛，并扩大战果。南云中将的决断，为美国人彻底失去抵抗，奠定了速胜的砝码。

无独有偶，日军在珍珠港东南侧快速登陆，造成了更大的震撼效果。日军突击大队很快突击到甘希姆机场南侧外围，此时第二批次空袭已经结束。机场上到处是熊熊燃烧的烈火，并伴随着零星的爆炸声，甘希姆机场处于极度混乱中。尽管机场上的警卫部队已经接到了日军在南侧登陆的消息，可是担任机场的警卫部队只有三百多人，根本不是日军的对手。

也许天照大神都在保佑日本人，就在日军刚开始向机场发动攻势时，恰好从美国本土飞来12架空中堡垒b17轰炸机，这些从美国本土飞来的轰炸机，经过长途旅行，一来是油料已经不多，二来是情况不明，他们在珍珠港见到这番情景全体发懵。机群在上空盘旋了几圈，无奈只好冒着危险在甘希姆机场降落。正好赶上日军突击大队发动进攻。

一副奇怪的图景出现，美军轰炸机一架接一架降落，没有人搭理他们。不少美军空军地勤人员，已经开始逃窜。而这边日军攻势如潮，不到半个小时，美军警卫部队便崩溃了，日军强大的战斗力，打得他们很快就像岛的北面撤退。下面的情景不用猜了，美军的轰炸机飞行员刚下飞机便成了俘虏，而这些刚刚到到达的美军轰炸机也意外的成了日军的战利品。

日军第三批次发动进攻不久，甘希姆机场已经被日军占领，日军攻击大队越战越勇，开始分兵追击美国残余的士兵。此时，美国太平洋海军司令部的高级将官，惊闻日军登陆部队占领了福特岛机场，接着是甘希姆机场。认为大势已去，司令官金梅尔率领司令部的将官，在瓦胡岛东侧登上一艘海岸炮艇，逃往夏威夷大岛。

金梅尔在逃跑之前，下了一个最正确的决定，那就是命令夏威夷群岛西北部中途岛上的美军舰艇和人员，向美国本土撤退

毫无组织、乱成一团的美军，彻底失去了抵抗能力。日军第三批次轰炸机飞临珍珠港上空轰炸不到十分钟，发现港湾内不少军舰已经挂上白旗投降，日军轰炸机开始盘旋在军港上空，对那些仍然在抵抗的美军军舰投掷恐吓炸弹，意为没有必要再进行抵抗。

更为混乱的是，港内不少军舰的水兵开始弃船，他们不断的向岸上逃窜。水兵不是傻瓜，出口水道已经堵死，他们几乎就是日军轰炸机的靶子。顿时美国水兵逃跑大军的队伍蔚为壮观，混乱由此加剧。

下午2时，一艘日军运输舰出现在在瓦胡岛西南侧，很快一个联队日军士兵于3时左右完成登陆。登陆的日军部队迅速形成两翼进攻梯队。与此同时，另一艘运输舰分别在驱除舰掩护下，继续实施登陆作战，随后西面几个岛屿日军陆续登陆。傍晚时分，一艘运输舰，在夏威夷大岛登陆，登陆过程中遭到了美军在岛部队上的抵抗。

可是很快日军便占领岸边，一个联队的日军士兵趁着天黑向纵深发展。同样是傍晚，日军登上火奴鲁鲁岛，占领檀香山所在地。整个夜晚枪声不断，日军部队在大踏步前进，没有人再能阻挡日军的脚步。这个夜晚，日军有一艘在南侧掩护登陆的驱除舰被美军在外面游弋的潜艇鱼雷击中沉没，这是日军损失的唯一一艘大型舰艇。